MAU+FFU+DCC洁净空调系统工程设计的核心是确定换气次数。由于按室内空调冷负荷计算得出的总风量一般与按室内允许含尘浓度计算得出的总风量不同，所以对应于换气次数也就有两个不同的值。在设计FFU+DDC洁净空调系统时，应分别计算出这两个换气次数，然后取用较大值。如果最终确定的换气次数对于空调冷负荷来说有较多的富裕量，则可由DDC自控调整干盘管的进水温度和出风参数来实现室内温、湿度参数的稳定。

由于FFU电动机的发热量较大，相当于增加了室内空调冷负荷，所以必须增加一部分风量用于排除FFU产生的热量。因此，在初步计算出通风量和FFU台数后，还要根据FFU产生的热量修正确定总风量和FFU台数。

根据新风风量选择新风机组，新风风量应满足卫生、正压和补充排风的要求。室内正压值由安装在墙板上的泄压阀调整。对于电子行业洁净室来说，室内的工作人员较少，一般可根据正压和补充排风的要求确定最大的新风风量。根据新风风量和负荷选择新风机组，并确定新风机组的过滤效率。根据回风风量计算干盘管的负荷，送风量减去新风量即是回风量，由此得到回风的比例，根据干盘管的负荷和洁净室的回风量选择干盘管的型号、台数。干盘管的进水温度一般应高于室内空气的露点温度。

室内人员发尘量计算，室内发尘源主要包括人和建筑表面、设备表面以及工艺过程。确定了FFU的过滤效率和新风机组的过滤效率后，便可以计算出FFU的送风含尘浓度，根据洁净室含尘浓度可以计算出换气次数，换气次数确定后便可以重新确定FFU的台数。